借出三千后只收回一千，这种情况能立案吗？

可以立案。借钱不还属民事纠纷，依据《民事诉讼法》，法院受理立案不受金额限制。不及时处理，可能导致债权无法追回，造成财产损失。
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常见处理方式为起诉或协商。若协商无果，建议选择起诉，通过法律途径维护权益；若关系较好，可先尝试协商，以和为贵。
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可以立案。操作如下：1.收集证据，如借条、转账记录等；2.尝试与对方协商，看能否达成一致；3.若协商无果，向法院提起诉讼，要求还款并交纳相应诉讼费。